La première étape dans la création de cette grande armée pour la République était de prélever les gènes de la souche. Quelques cellules de Jango Fett suffirent pour cette première étape. Elles furent analysées, comparées aux schémas type de la morphologie humaine puis manipulées par un groupe de scientifiques assidus qui en dégagea une première ébauche, vide de toute imperfection corporelle. Les muscles furent génétiquement améliorés pour un entraînement plus difficile et manipulés pour qu'ils soient plus puissants. Le coeur amélioré pour subir des efforts importants, les os plus robustes pour un meilleur squelette, taillé pour le combat. Les scientifiques s'attaquèrent ensuite au cerveau du soldat clone. Celui-ci devait être de taille normale mais beaucoup plus performant. Les connexions neuronales furent améliorées pour une capacité d'apprentissage plus grande, toutefois, la partie du cerveau qui commandait la personnalité du soldat, celle qui en faisait une personne autonome fut remodelée pour qu'il ne se considère pas comme un être unique, mais comme un soldat faisant parti d'un tout plus grand. Les modifications annihilèrent le libre arbitre des soldats, ils n'avaient plus la faculté de se rebeller contre leurs supérieurs, et ne pouvaient qu'obéir sans broncher. Ils étaient destinés à devenir des individus pensants sans aucune personnalité propre, sans aucun moyen d'exprimer leurs sentiments.
Des cellules parfaites, répondant à tous ces critères, furent alors créées. Elles furent dupliquées, encore et encore jusqu'à donner un embryon artificiel. Un technique innovante fut mise au point pour créer des embryons massivement en laboratoire. Leur croissance était accélérée pour qu'ils puissent être opérationnels en deux fois moins de temps que la normale. De grands complexes accueillirent les milliers d'embryons produis et les disposèrent sur de longues structures qui leur apportent nourriture, eau et chaleur. Il pouvait y avoir près de cents embryons sur une seule se ces structures.
Dès qu'ils peuvent comprendre et communiquer, on façonne leur esprit aux techniques militaires, à l'obéissance, à la discipline. On leur inculque des valeurs comme le courage, le sacrifice de soi-même. Un programme d'enseignement intensif leur est dispensé par l'intermédiaire de casques et de simulations de combats sur des écrans. Ces casques augmentent leurs facultés mémorielles en modulant leurs fréquences cérébrales. Deux micros sont disposés de part en part du casque pour que la voix ne soit pas partiellement transmise. Des écouteurs placés sur les bords du casque étouffent les bruits extérieurs, assurant un environnement sonore isolé afin d'améliorer l'apprentissage. Des récepteurs de signal transmettent les communications entre soldats mais aussi entre les formateurs et les soldats. Ces casques sont codés à l'aide de couleurs qui traduisent un numérotation. C'est la seule marque distinctive qui est autorisée aux soldats clones. Il existe deux types de casques: l'un blanc avec des bandes mauves et l'autre mauve avec des bandes blanches. L'un est un casque de type "Impair" l'autre de type "Pair". Chaque soldat pair est entouré des deux soldats impairs, c'est la seule différence visible par des yeux humains.
Au stade suivant, les soldats clones expérimentent leur adresse ou leurs techniques de combat au corps à corps dans des salles d'entraînement spéciales. Ils se battent l'un contre l'autre ou contre des machines ressemblant à des humains. Une fois "adulte", les soldats clones ressemblent à leur souche, Jango Fett. Fett vit sur Kamino et contribue à la formation, étant le mieux placé pour perfectionner ces copies de lui-même.
Soucieux d'uniformité, les Kaminoans s'efforcent de contrôler chaque aspect de l'existence des clones; mais de subtiles déviations interviennent toujours dans le développement biochimique d'un être vivant. La Chef Scientifique Ko Sai inspecte donc les clones à chaque stade de leur croissance, afin de repérer ceux qui se sont éloignés de la norme. Tout clone déviant est reconditionné. Les cloneurs doivent reconditionner sept clones déviants pour deux cents produits, ce qui constitue une performance remarquable. Pour arriver à ce résultat, les cloneurs ont imposé dans les salles où se trouvent les clones, des méthodes de stérilisation absolue pour que les locaux soient ultrapropres et que les clones soient en tout point parfait. Une telle rigueur peut surprendre des personnes extérieures à la planète mais les Kaminoans trouvent cela normal. Les clones sont entraînés par groupe restreint dans un environnement qui limite une vie communautaire, afin d'assurer leur stabilité émotionnelle.